Bifidobacterium kan effektivt hemme vanlig ødeleggelse og lav - temperaturbakterier. Den antibakterielle effekten er hovedsakelig gjennom konkurranse om ernæring og vedheftsteder, produksjon av antibakterielle stoffer og styrking av kroppens immunitet. Det har en effekt på vedheft og reproduksjon av tarmpatogene bakterier. Å antagonisme og blokkere patogenesen av sykdom. De antibakterielle stoffene produsert av bifidobakterier er hovedsakelig organiske syrer, bakteriociner, bakteriociner og andre antibakterielle stoffer.
Flyktige korte - kjedefettsyrer som melkesyre og eddiksyre, som er metabolitter av bifidobakterier, øker konsentrasjonen av hydrogenioner i miljøet, som er høyere enn konsentrasjonen av hydrogenioner i cellene til patogene bakterier. Hydrogenionene trenger inn i cellene i patogene bakterier for å gjøre dem forsuring av cytoplasma påvirker dens vekst og inaktiverer til og med patogene bakterier for å oppnå antibakterielle effekter.
Studier har vist at gjæringsbuljong bifidobakterier har åpenbar antibakteriell effekt in vitro, og lav pH er en viktig tilstand for dens antibakterielle effekt. I tillegg kan noen bifidobakterier metabolisere for å produsere et protein syntetisert av ribosomer med antibakterielle effekter, kalt bakterieltoksiner, som kan hemme veksten av andre patogene bakterier.